杭州公司是九州通医药集团在华东市场的重点项目之一，位于杭州市萧山经济开发区红垦农场垦辉六路1号，占地面积56亩，建筑面积3.6万平方米，现有员工近600人，经营范围包括：中药材、中成药、中药饮片、化学原料药、化学药制剂、抗生素原料药、抗生素制剂、生化药品、生物制品、医疗器械、经营各类商品和技术的进出口、会务服务等。目前拥有总资产近1.5亿元，注册资本8000万元。公司现代医药物流分拣中心正式上线，物流中心采用九州通自主研发的LMIS6.0物流管理信息系统，仓储面积28000平米，拥有30000个货位，可支持年30亿元的销售，目前在浙江温州及仙居开设地级公司。

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